O local das aparições deram lugar a uma capela no ano seguinte e 90 anos depois foi inaugurada uma segunda basílica com lotação para 9000 fiéis sentados.
PUBLICIDADEA 13 de maio de 1917, Nossa Senhora do Rosário de Fátima terá aparecido pela primeira vez perante os irmãos Jacinta e Francisco Marto e a prima destes, Lúcia dos Santos, os três Pastorinhos. A história do Santuário de Fátima começou aí, mas a construção só arrancou dois anos depois, em 1919.
Uma capela em Sua honra terá sido um dos pedidos da Senhora do Rosário às três crianças. A Capela das Aparições foi a resposta dos fiéis. Após ser benzida, foi palco da primeira missa a 13 de outubro de 1921.
A 13 de maio de 1928, foi lançada a primeira pedra da Basílica de Nossa Senhora do Rosário, onde estão hoje sepultados os Três Pastorinhos.
Em 1930, após autorização do Vaticano, José Alves Correia da Silva, o então bispo de Leiria, a diocese responsável pela zona das Aparições, oficializou o culto a Nossa Senhora do Rosário de Fátima.
A crescente afluência de peregrinos, ao longo dos anos, motivou o progressivo alargamento do Santuário. Uma colunata viria a juntar todos os espaços entretanto “nascidos” no complexo.
Em 2007, nos 90 anos das Aparições, foi inaugurada a Basílica da Santíssima Trindade, um projeto de 70 milhões de euros, financiado pelas ofertas dos fiéis. A nova Basílica tem lugar para 9000 pessoas sentadas.
As visitas de Papas ao Santuário
Paulo VI foi, em 1967, o primeiro Papa a visitar o Santuário de Papa. João Paulo II esteve em Fátima por três ocasiões, a primeira em 1982 para agradecer a suposta proteção divina de Nossa Senhora de Fátima numa tentativa de assassinato sofrida no ano anterior. O Sumo Pontíficie viria a sofrer outro atentado em Portugal e a sobreviver.
Na terceira visita, a 13 de maio de 2000, João Paulo II beatificou os Pastorinhos Jacinta e Francisco Marto. Havia também a expetativa do terceiro segredo de Fátima, que teria sido o atentado contra o Papa em 1981.
Bento XVI visitou o Santuário em 2010.
Francisco é o quarto Papa em Fátima, numa altura em que o Santuário é visitado por oito milhões de pessoas a cada ano. Só no fim de semana do Centenário das Aparições são esperadas mais de um milhão de pessoas.
A celebração do Centenário das Aparições servirá também para o Sumo Pontíficie canonizar os dois Pastorinhos mais novos, Jacinta e Francisco Marto.